Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SARM1Q6SZW1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms