Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD1Q6SPF0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms