Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8EQ6NSJ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms