Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RCSD1Q6JBY9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms