Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF43Q68DV7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms