Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFMBT2Q5VUG0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms