Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATAD3BQ5T9A4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3BQ5T9A4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms