Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms