Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM240Q5SV17 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms