Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms