Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TTC39AQ5SRH9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39AQ5SRH9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms