Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSL3PQ5NE16 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms