Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms