Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47A1Q5JQC4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CT47A1Q5JQC4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CT47A1Q5JQC4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CT47A1Q5JQC4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CT47A1Q5JQC4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CT47A1Q5JQC4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CT47A1Q5JQC4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CT47A1Q5JQC4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CT47A1Q5JQC4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CT47A1Q5JQC4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms