Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms