Protein–RNA interactions for Protein: Q1W4C9

SPINK13, Serine protease inhibitor Kazal-type 13, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK13Q1W4C9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK13Q1W4C9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK13Q1W4C9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms