Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEN1Q17RS7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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