Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPROQ16827 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms