Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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RAB11BQ15907 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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RAB11BQ15907 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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RAB11BQ15907 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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RAB11BQ15907 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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RAB11BQ15907 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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RAB11BQ15907 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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