Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN9AQ15858 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN9AQ15858 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
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