Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPTX1Q15818 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.3 ms