Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH1Q15438 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms