Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
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