Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms