Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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