Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H3Q13889 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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