Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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