Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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