Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
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PTPRSQ13332 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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PTPRSQ13332 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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PTPRSQ13332 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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PTPRSQ13332 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRSQ13332 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
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