Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MTA1Q13330 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA1Q13330 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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