Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ERCC8Q13216 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ERCC8Q13216 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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