Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAF1AQ13111 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.56■■■□□ 2
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