Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK2Q13002 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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