Protein–RNA interactions for Protein: Q12470

TY1A-NL2, Transposon Ty1-NL2 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL2Q12470 YJR114WYJR114W 393 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YPL073CYPL073C 486 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 CAR1YPL111W 1002 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 PPT2YPL148C 522 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YMC1YPR058W 924 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 UTR2YEL040W 1404 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 AQR1YNL065W 1761 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 COT1YOR316C 1320 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 ADY4YLR227C 1482 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 WHI2YOR043W 1461 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 NSI1YDR026C 1713 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 FRE7YOL152W 1863 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 IES5YER092W 378 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 MAM1YER106W 909 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 SVP26YHR181W 687 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YKL053WYKL053W 375 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YKR011CYKR011C 1062 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 PTH2YBL057C 627 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 KSH1YNL024C-A 219 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YOR343CYOR343C 327 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 CTS2YDR371W 1536 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 PAP2YOL115W 1755 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 NKP1YDR383C 717 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 FMP48YGR052W 1110 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 CHS7YHR142W 951 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 ACF4YJR083C 930 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YPT52YKR014C 705 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YML009C-AYML009C-A 327 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 VPS71YML041C 843 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 SIW14YNL032W 846 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 PUS4YNL292W 1212 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 NIP7YPL211W 546 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 GPX2YBR244W 489 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 PRP31YGR091W 1485 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 SAM50YNL026W 1455 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 MPA43YNL249C 1629 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 STE12YHR084W 2067 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 NOP12YOL041C 1380 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 SEC4YFL005W 648 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YGR045CYGR045C 363 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YLR374CYLR374C 390 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 NIS1YNL078W 1224 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 CSM4YPL200W 471 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 MMT2YPL224C 1455 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 MRN1YPL184C 1839 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 MFB1YDR219C 1398 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 YJL049WYJL049W 1353 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-NL2Q12470 AGP2YBR132C 1791 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 PHO13YDL236W 939 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 COS4YFL062W 1140 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YLR294CYLR294C 330 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 AIM33YML087C 939 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YNL043CYNL043C 321 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YNR071CYNR071C 1029 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 RPB5YBR154C 648 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 NDE2YDL085W 1638 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 PMT1YDL095W 2454 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 IME2YJL106W 1938 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 FBP26YJL155C 1359 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 TDA6YPR157W 1404 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 VFA1YER128W 612 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 SBP1YHL034C 885 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YIL028WYIL028W 399 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 SDP1YIL113W 630 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 GPX1YKL026C 504 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 MRPL17YNL252C 846 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 DDP1YOR163W 567 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YOR282WYOR282W 321 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 TRM82YDR165W 1335 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 HST3YOR025W 1344 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 SAN1YDR143C 1833 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 TRM13YOL125W 1431 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YGL176CYGL176C 1665 nt6.94□□□□□ -1.3
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TY1A-NL2Q12470 YKR018CYKR018C 2178 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YDL032WYDL032W 312 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 ADE8YDR408C 645 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 FZF1YGL254W 900 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 AML1YGR001C 747 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 PHB2YGR231C 933 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 MPC2YHR162W 390 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 IKI1YHR187W 930 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YIL152WYIL152W 708 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 ASG7YJL170C 630 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 HRI1YLR301W 735 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 TAF13YML098W 504 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 PEP12YOR036W 867 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 snR31snR31 225 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 PYK2YOR347C 1521 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL2Q12470 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt6.94□□□□□ -1.3
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