Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.17□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 YIR043CYIR043C 693 nt5.17□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 ISY1YJR050W 708 nt5.17□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 MED4YOR174W 855 nt5.17□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 DSE3YOR264W 1293 nt5.17□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 SPO19YPL130W 672 nt5.17□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 WHI4YDL224C 1950 nt5.16□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 FAR10YLR238W 1437 nt5.16□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 YDL012CYDL012C 324 nt5.16□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 PRP28YDR243C 1767 nt5.16□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 HOF1YMR032W 2010 nt5.15□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.15□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.15□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.15□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 YPL025CYPL025C 558 nt5.15□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 UMP1YBR173C 447 nt5.15□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 STR2YJR130C 1920 nt5.15□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 LPL1YOR059C 1353 nt5.15□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 YLH47YPR125W 1365 nt5.15□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 YDL027CYDL027C 1263 nt5.14□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 IRC7YFR055W 1023 nt5.14□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 NMA1YLR328W 1206 nt5.14□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 YBL081WYBL081W 1107 nt5.14□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 SCP1YOR367W 603 nt5.14□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 KRS1YDR037W 1776 nt5.14□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 TOG1YER184C 2385 nt5.13□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 ARF2YDL137W 546 nt5.13□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 TYW3YGL050W 822 nt5.13□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 AIF1YNR074C 1137 nt5.13□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 AIM41YOR215C 558 nt5.13□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 TIP41YPR040W 1071 nt5.13□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 MUM3YOR298W 1440 nt5.13□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 MAG2YLR427W 2013 nt5.13□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 GAD1YMR250W 1758 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 IPK1YDR315C 846 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 MMS2YGL087C 414 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 YHR095WYHR095W 495 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 MRPL39YML009C 213 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 TSL1YML100W 3297 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 WTM1YOR230W 1314 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 GSY1YFR015C 2127 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 RAD52YML032C 1416 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 ARH1YDR376W 1482 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 NOP8YOL144W 1455 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 RIM21YNL294C 1602 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 YTA12YMR089C 2478 nt5.12□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 RPG1YBR079C 2895 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 HIS4YCL030C 2400 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 RPS16BYDL083C 432 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 RTT103YDR289C 1230 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 BNA6YFR047C 888 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 VPS29YHR012W 849 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 SPC42YKL042W 1092 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 NTR2YKR022C 969 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 YNL217WYNL217W 981 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 YNR068CYNR068C 819 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 UBA3YPR066W 900 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 UTP6YDR449C 1323 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 SVF1YDR346C 1446 nt5.11□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 RPL12AYEL054C 498 nt5.1□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 TIF4632YGL049C 2745 nt5.1□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 SPO12YHR152W 522 nt5.1□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 UBI4YLL039C 1146 nt5.1□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 PML1YLR016C 615 nt5.1□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 CSR1YLR380W 1227 nt5.1□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 FHL1YPR104C 2811 nt5.1□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 SAP155YFR040W 3009 nt5.1□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 YMR221CYMR221C 1515 nt5.09□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 snR7-LsnR7-L 214 nt5.09□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 YDL124WYDL124W 939 nt5.09□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 THI13YDL244W 1023 nt5.09□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 PCL6YER059W 1263 nt5.09□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 THI11YJR156C 1023 nt5.09□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 RAD27YKL113C 1149 nt5.09□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 RRT7YLL030C 342 nt5.09□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 TAF4YMR005W 1167 nt5.09□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 PIM1YBL022C 3402 nt5.09□□□□□ -1.59
LSP1Q12230 UPC2YDR213W 2742 nt5.08□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 NUP42YDR192C 1293 nt5.08□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 YGL118CYGL118C 438 nt5.08□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 LOH1YJL038C 660 nt5.08□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 TOM7YNL070W 183 nt5.08□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 ARG8YOL140W 1272 nt5.08□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 CIN5YOR028C 888 nt5.08□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 ALG2YGL065C 1512 nt5.07□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 YDR132CYDR132C 1488 nt5.07□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 RSM23YGL129C 1353 nt5.07□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 MDM34YGL219C 1380 nt5.07□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 TPO2YGR138C 1845 nt5.07□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 UPS3YDR185C 540 nt5.07□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 FEX1YOR390W 1128 nt5.07□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 FEX2YPL279C 1128 nt5.07□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 SRV2YNL138W 1581 nt5.07□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 TFG1YGR186W 2208 nt5.07□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 RTC1YOL138C 4026 nt5.06□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 YKR075CYKR075C 924 nt5.06□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 MTF1YMR228W 1026 nt5.06□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 YDC1YPL087W 954 nt5.06□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 SKG6YHR149C 2205 nt5.06□□□□□ -1.6
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