Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 UBP9YER098W 2265 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 PXA1YPL147W 2613 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 IMA1YGR287C 1770 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 TRM8YDL201W 861 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 HSP31YDR533C 714 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 HPM1YIL110W 1134 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 MTG1YMR097C 1104 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 YNL174WYNL174W 573 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 ARG8YOL140W 1272 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 UBA3YPR066W 900 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 GCN20YFR009W 2259 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 FUM1YPL262W 1467 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 SAY1YGR263C 1275 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 YGR283CYGR283C 1026 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 MRPL6YHR147C 645 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 YJL215CYJL215C 360 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 YIP3YNL044W 531 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 TRM10YOL093W 882 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 DCP1YOL149W 696 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 COX11YPL132W 903 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 NHP6AYPR052C 282 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 TPS3YMR261C 3165 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 SEO1YAL067C 1782 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 YJL206CYJL206C 2277 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 SER33YIL074C 1410 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 FZO1YBR179C 2568 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 CMK1YFR014C 1341 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 ASA1YPR085C 1332 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 DNF2YDR093W 4839 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 MRPL32YCR003W 552 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 YGR153WYGR153W 654 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 GRE3YHR104W 984 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 CKB2YOR039W 777 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 PEX27YOR193W 1131 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 SLX1YBR228W 915 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 TUB2YFL037W 1374 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 ARG4YHR018C 1392 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 STE20YHL007C 2820 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 MGR3YMR115W 1506 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 YCR016WYCR016W 873 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 YDR222WYDR222W 1248 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 GRX4YER174C 735 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 AUA1YFL010W-A 285 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 SPO74YGL170C 1242 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 YNG2YHR090C 849 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 ATG19YOL082W 1248 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 SRB6YBR253W 366 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 BUD22YMR014W 1560 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX3Q12229 VPS36YLR417W 1701 nt4.77□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 MPH2YDL247W 1830 nt4.77□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.77□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 ARD1YHR013C 717 nt4.77□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 CTL1YMR180C 963 nt4.77□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 BTS1YPL069C 1008 nt4.77□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 SUI3YPL237W 858 nt4.77□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 CKS1YBR135W 453 nt4.77□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 KCC4YCL024W 3114 nt4.77□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YAP1802YGR241C 1707 nt4.77□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 AIR2YDL175C 1035 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 NSE3YDR288W 912 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 NOP16YER002W 696 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 RPS0BYLR048W 759 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YOR289WYOR289W 756 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 snR17bsnR17b 332 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 TAZ1YPR140W 1146 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 MCX1YBR227C 1563 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 DBF4YDR052C 2115 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 DRN1YGR093W 1524 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 ALD3YMR169C 1521 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 ALD2YMR170C 1521 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 RAD57YDR004W 1383 nt4.76□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 PCL2YDL127W 927 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YDR336WYDR336W 945 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 BUD16YEL029C 939 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 ERV14YGL054C 417 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 CAX4YGR036C 720 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YHR214WYHR214W 612 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YKL023WYKL023W 834 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YAR066WYAR066W 612 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YOL107WYOL107W 1029 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 TFB6YOR352W 1032 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 MET16YPR167C 786 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 CYK3YDL117W 2658 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 DOA1YKL213C 2148 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 SIP5YMR140W 1470 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 HRR25YPL204W 1485 nt4.75□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YNL095CYNL095C 1929 nt4.74□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 INO2YDR123C 915 nt4.74□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YFT2YDR319C 825 nt4.74□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YEL067CYEL067C 588 nt4.74□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YPL199CYPL199C 723 nt4.74□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 HSP26YBR072W 645 nt4.74□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 RRN3YKL125W 1884 nt4.74□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 GMC1YDR506C 1827 nt4.74□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 IMD3YLR432W 1572 nt4.74□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 TFG1YGR186W 2208 nt4.73□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 RKM2YDR198C 1440 nt4.73□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 CDC4YFL009W 2340 nt4.73□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 ALG2YGL065C 1512 nt4.73□□□□□ -1.65
UBX3Q12229 YDL183CYDL183C 963 nt4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms