Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 ACF2YLR144C 2340 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YIG1YPL201C 1386 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 RPL27BYDR471W 411 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 DIG2YDR480W 972 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 RPN12YFR052W 825 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YJR114WYJR114W 393 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YPL073CYPL073C 486 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 CAR1YPL111W 1002 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 PPT2YPL148C 522 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YMC1YPR058W 924 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 UTR2YEL040W 1404 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 AQR1YNL065W 1761 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 COT1YOR316C 1320 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 ADY4YLR227C 1482 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 WHI2YOR043W 1461 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 NSI1YDR026C 1713 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 FRE7YOL152W 1863 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 IES5YER092W 378 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 MAM1YER106W 909 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 SVP26YHR181W 687 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YKL053WYKL053W 375 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YKR011CYKR011C 1062 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 PTH2YBL057C 627 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 KSH1YNL024C-A 219 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YOR343CYOR343C 327 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 CTS2YDR371W 1536 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 PAP2YOL115W 1755 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 NKP1YDR383C 717 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 FMP48YGR052W 1110 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 CHS7YHR142W 951 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 ACF4YJR083C 930 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YPT52YKR014C 705 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YML009C-AYML009C-A 327 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 VPS71YML041C 843 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 SIW14YNL032W 846 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 PUS4YNL292W 1212 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 NIP7YPL211W 546 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 GPX2YBR244W 489 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 PRP31YGR091W 1485 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 SAM50YNL026W 1455 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 MPA43YNL249C 1629 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 STE12YHR084W 2067 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 NOP12YOL041C 1380 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 SEC4YFL005W 648 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YGR045CYGR045C 363 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YLR374CYLR374C 390 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 NIS1YNL078W 1224 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 CSM4YPL200W 471 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 MMT2YPL224C 1455 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 MRN1YPL184C 1839 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 MFB1YDR219C 1398 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YJL049WYJL049W 1353 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 AGP2YBR132C 1791 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 PHO13YDL236W 939 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 COS4YFL062W 1140 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YLR294CYLR294C 330 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 AIM33YML087C 939 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YNL043CYNL043C 321 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YNR071CYNR071C 1029 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 RPB5YBR154C 648 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 NDE2YDL085W 1638 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 PMT1YDL095W 2454 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 IME2YJL106W 1938 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 FBP26YJL155C 1359 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 TDA6YPR157W 1404 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 CAB5YDR196C 726 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 VFA1YER128W 612 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 SBP1YHL034C 885 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YIL028WYIL028W 399 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 SDP1YIL113W 630 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 GPX1YKL026C 504 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 MRPL17YNL252C 846 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 DDP1YOR163W 567 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YOR282WYOR282W 321 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 TRM82YDR165W 1335 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 HST3YOR025W 1344 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 SAN1YDR143C 1833 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 TRM13YOL125W 1431 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YGL176CYGL176C 1665 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YJL045WYJL045W 1905 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YKR018CYKR018C 2178 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YDL032WYDL032W 312 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 ADE8YDR408C 645 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 FZF1YGL254W 900 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 AML1YGR001C 747 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 PHB2YGR231C 933 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 MPC2YHR162W 390 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 IKI1YHR187W 930 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YIL152WYIL152W 708 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 ASG7YJL170C 630 nt6.94□□□□□ -1.3
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