Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM2AQ08AH3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms