Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms