Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKCZQ05513 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms