Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF90Q03938 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms