Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms