Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPIBQ01892 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms