Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXK2Q01167 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXK2Q01167 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXK2Q01167 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms