Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SCN7AQ01118 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms