Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms