Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC5Q00444 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms