Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
TMF1P82094 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMF1P82094 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMF1P82094 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMF1P82094 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
TMF1P82094 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
TMF1P82094 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMF1P82094 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMF1P82094 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMF1P82094 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMF1P82094 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMF1P82094 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMF1P82094 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMF1P82094 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMF1P82094 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMF1P82094 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMF1P82094 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMF1P82094 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TMF1P82094 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TMF1P82094 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TMF1P82094 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMF1P82094 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TMF1P82094 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TMF1P82094 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TMF1P82094 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMF1P82094 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMF1P82094 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMF1P82094 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMF1P82094 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMF1P82094 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMF1P82094 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMF1P82094 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMF1P82094 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMF1P82094 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMF1P82094 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMF1P82094 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMF1P82094 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMF1P82094 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMF1P82094 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMF1P82094 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMF1P82094 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
TMF1P82094 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMF1P82094 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMF1P82094 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMF1P82094 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMF1P82094 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMF1P82094 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMF1P82094 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMF1P82094 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMF1P82094 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMF1P82094 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMF1P82094 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMF1P82094 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMF1P82094 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMF1P82094 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TMF1P82094 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMF1P82094 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMF1P82094 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TMF1P82094 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TMF1P82094 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMF1P82094 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TMF1P82094 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMF1P82094 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMF1P82094 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMF1P82094 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMF1P82094 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMF1P82094 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMF1P82094 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMF1P82094 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMF1P82094 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMF1P82094 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TMF1P82094 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMF1P82094 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMF1P82094 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMF1P82094 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMF1P82094 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms