Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFI35P80217 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFI35P80217 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFI35P80217 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFI35P80217 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFI35P80217 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFI35P80217 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFI35P80217 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFI35P80217 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFI35P80217 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFI35P80217 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFI35P80217 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFI35P80217 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFI35P80217 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFI35P80217 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFI35P80217 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFI35P80217 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFI35P80217 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFI35P80217 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFI35P80217 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFI35P80217 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFI35P80217 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFI35P80217 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFI35P80217 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFI35P80217 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFI35P80217 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFI35P80217 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFI35P80217 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFI35P80217 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFI35P80217 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFI35P80217 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFI35P80217 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFI35P80217 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFI35P80217 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFI35P80217 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFI35P80217 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFI35P80217 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFI35P80217 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFI35P80217 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFI35P80217 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFI35P80217 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFI35P80217 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFI35P80217 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFI35P80217 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IFI35P80217 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFI35P80217 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFI35P80217 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFI35P80217 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFI35P80217 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFI35P80217 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFI35P80217 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFI35P80217 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFI35P80217 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFI35P80217 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFI35P80217 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFI35P80217 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFI35P80217 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFI35P80217 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFI35P80217 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFI35P80217 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFI35P80217 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFI35P80217 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFI35P80217 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFI35P80217 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFI35P80217 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFI35P80217 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFI35P80217 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFI35P80217 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFI35P80217 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFI35P80217 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFI35P80217 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IFI35P80217 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFI35P80217 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFI35P80217 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms