Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC1P78348 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms